POSIX Rechte und ACLs werden intern mit UID/GID gespeichert. Wenn du nur den Login Namen und ggf. den Gruppennamen (bei unverändertem GID) umbenennst, bleiben Dateibesitz und ACLs bestehen; die Namen werden beim Anzeigen nur neu aufgelöst. Zuerst benennst du den Benutzer um.
sudo usermod -l <neuer-name> <alter-name>
Danach kannst du sein Heimverzeichnis verschieben.
sudo mv /home/<alter-name> /home/<neuer-name>
und den Pfad für das Heimverzeichnis des Benutzer anpassen.
sudo usermod -d /home/<neuer-name> <neuer-name>
Am Ende benennst du noch seine Benutzergruppe um.
sudo groupmod -n <neuer-name> <alter-name>